More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1358 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1358  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3371  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  72.64 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1305  tRNA pseudouridine synthase A  54.14 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0505813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2002  tRNA pseudouridine synthase A  53.63 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.402759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1665  tRNA pseudouridine synthase A  55.23 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298328  normal  0.709625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  35.17 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  31.11 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  31.63 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.65 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.9 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  32.82 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  30.5 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  28.63 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  31.78 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  35.91 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  32.18 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1662  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 261 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 261 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  28.29 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  32.31 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.02 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  29.18 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  27.66 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  32.17 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  29.5 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  29.73 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 244 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  29.3 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  29.5 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  31.78 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4870  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  29.01 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3817  tRNA pseudouridine synthase A  31.01 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  29.25 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  31.22 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  30.23 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  31.78 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  31.27 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1086  tRNA pseudouridine synthase A  30.15 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23281  tRNA pseudouridine synthase A  31.2 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  34.75 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  35.52 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1523  tRNA pseudouridine synthase A  31.03 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000575068  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0364  tRNA pseudouridine synthase A  31.22 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  29.28 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  31.53 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1735  pseudouridylate synthase  28.87 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  28.68 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  31.01 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  29.3 
 
 		 250 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  29.49 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  31.54 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  29.23 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2269  tRNA-pseudouridine synthase I  33.72 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.584541  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  30.73 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  31.06 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  31.19 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19791  tRNA pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1417  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  28.02 
 
 		 245 aa  85.9  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  30.62 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  30.08 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1280  tRNA pseudouridine synthase A  26.16 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  30.62 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  28.68 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  31.01 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0037  tRNA pseudouridine synthase A  32.72 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  25.95 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.68 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0213  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.94 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0717474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>