More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3371 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3371  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  100 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1358  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  72.64 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2002  tRNA pseudouridine synthase A  57.73 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.402759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1305  tRNA pseudouridine synthase A  52.74 
 
 		 263 aa  271  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0505813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1665  tRNA pseudouridine synthase A  55.32 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298328  normal  0.709625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  32.53 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  34.83 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  30.04 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  38.26 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  29.04 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  32.59 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  36.67 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  31.48 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  37.12 
 
 		 272 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.46 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19791  tRNA pseudouridine synthase A  30.19 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  31.51 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1525  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  28.08 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  30.6 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  32.57 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  30.68 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1104  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.723318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0696  tRNA pseudouridine synthase A  34.31 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.214001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  31.42 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  36.09 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  32.31 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  29.28 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  35.09 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  31.87 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  28.85 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  29.28 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  29.28 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  31.32 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  32.32 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  31.72 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  32.7 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  33.82 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  30.19 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  29.48 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  31.46 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  29.18 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  30.57 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.16 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  29.59 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  30.71 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  30.3 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  29.59 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2576  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16531  tRNA pseudouridine synthase A  29 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0673067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  30.27 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.44 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2269  tRNA-pseudouridine synthase I  34.72 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.584541  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  30.38 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  32.35 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.43 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 		 245 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  29.06 
 
 		 264 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.54 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  28.41 
 
 		 253 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  28.3 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1662  tRNA pseudouridine synthase A  29.92 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0351  tRNA pseudouridine synthase A  33.18 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 		 252 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6581  tRNA-pseudouridine synthase I  34.14 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  28.98 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  26.64 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  33.96 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>