More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1042 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1042  type II secretion system protein  100 
 
 		 399 aa  773    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  34.99 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.9 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.25 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  37.44 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  37.06 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.5 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.57 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 419 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  36.34 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  34.41 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  34.51 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 406 aa  245  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 406 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.67 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.07 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 420 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 424 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.17 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  35.84 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.5 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  36.78 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  33.74 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.78 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  34.77 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  35.42 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  33.76 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  33 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  34.12 
 
 		 407 aa  235  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  34.57 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.41 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.5 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  37.84 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  33.76 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  31.44 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.21 
 
 		 409 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.66 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  35.8 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.25 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.34 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.08 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  32.75 
 
 		 419 aa  225  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 422 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  33.76 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  39.85 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.99 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  36.14 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.92 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  32.15 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  31.6 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.75 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>