More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1636 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1636  ABC transporter related  100 
 
 
536 aa  1082    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  50 
 
 
533 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3473  ABC transporter related  48.36 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3346  ABC transporter related  47.98 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02099  hypothetical protein  48.16 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  28.57 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.02 
 
 
576 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  27.92 
 
 
606 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.91 
 
 
612 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.57 
 
 
589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  26.06 
 
 
588 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  31.75 
 
 
573 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  24.69 
 
 
611 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.24 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  24.43 
 
 
593 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
575 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.81 
 
 
581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
575 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  23.77 
 
 
597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  26.56 
 
 
603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  25.51 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  25.9 
 
 
578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  25.6 
 
 
600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  26.54 
 
 
552 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  23.44 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  27.9 
 
 
576 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 
593 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  24.51 
 
 
593 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  22.5 
 
 
587 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  22.5 
 
 
587 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  22.75 
 
 
566 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  22.75 
 
 
566 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  30.45 
 
 
556 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  25.21 
 
 
580 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  23.51 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  28.78 
 
 
574 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.82 
 
 
588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  23.04 
 
 
619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  29.69 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  22.18 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  29.69 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  25.22 
 
 
598 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  23.02 
 
 
584 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  22.54 
 
 
597 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  23.31 
 
 
608 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.66 
 
 
618 aa  120  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  27.49 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.71 
 
 
578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.55 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.24 
 
 
581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.45 
 
 
588 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  26.6 
 
 
1205 aa  118  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  24.55 
 
 
613 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.7 
 
 
582 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.15 
 
 
570 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  26.2 
 
 
581 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  23.19 
 
 
663 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  23.48 
 
 
598 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  22.76 
 
 
573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.89 
 
 
573 aa  116  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  26.22 
 
 
562 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  22.41 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  34.15 
 
 
206 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  26.5 
 
 
581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  24.81 
 
 
1194 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.06 
 
 
600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  23.53 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  28.33 
 
 
993 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  25.52 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  22.59 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  24.05 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  26.83 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  25.32 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  26.22 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.3 
 
 
595 aa  115  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  24.5 
 
 
585 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  28.72 
 
 
571 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  24.5 
 
 
577 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  23.68 
 
 
604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  24.71 
 
 
571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  21.62 
 
 
599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  26.6 
 
 
596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  26.12 
 
 
583 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  21.77 
 
 
573 aa  114  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  23.86 
 
 
572 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  25.16 
 
 
579 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  23.95 
 
 
581 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  34.8 
 
 
206 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003746  transport ATP-binding protein CydC  25.94 
 
 
573 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  24.19 
 
 
583 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
223 aa  113  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.28 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  27.27 
 
 
565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.48 
 
 
721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0725  ABC transporter related  25.67 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  21.71 
 
 
577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  27.13 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1150  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.66 
 
 
576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.91348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  24.74 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  24.75 
 
 
624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>