More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02099 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02099  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1083    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1636  ABC transporter related  48.99 
 
 
536 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3473  ABC transporter related  46.73 
 
 
532 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  47.05 
 
 
533 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3346  ABC transporter related  46.35 
 
 
532 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 
612 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  31.27 
 
 
573 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  26.78 
 
 
577 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  28.95 
 
 
611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
606 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.89 
 
 
576 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.03 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  24.9 
 
 
588 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  26.49 
 
 
595 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  31.24 
 
 
575 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  31.24 
 
 
575 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  25.45 
 
 
578 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  24.34 
 
 
592 aa  143  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  23.6 
 
 
593 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  24.28 
 
 
584 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  25.71 
 
 
598 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  24.38 
 
 
599 aa  133  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  25.36 
 
 
608 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.09 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  22.36 
 
 
573 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.21 
 
 
578 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  27.38 
 
 
603 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  22.82 
 
 
573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.31 
 
 
583 aa  127  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  25.4 
 
 
609 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.36 
 
 
597 aa  127  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.35 
 
 
581 aa  126  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.83 
 
 
570 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  23.15 
 
 
580 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  24.77 
 
 
584 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  23.26 
 
 
573 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  23.66 
 
 
585 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  26.72 
 
 
574 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  26.19 
 
 
552 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  26.67 
 
 
596 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  21.51 
 
 
587 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  21.51 
 
 
587 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  28.3 
 
 
562 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  38.25 
 
 
206 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.76 
 
 
584 aa  121  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  35.46 
 
 
663 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0739  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  35.62 
 
 
586 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0348008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  24.84 
 
 
597 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  29.98 
 
 
574 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1055  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133611  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1021  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000555337  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1410  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.55 
 
 
573 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215982  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  24.37 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  37.93 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  23.94 
 
 
571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  40 
 
 
594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  25.26 
 
 
580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  40 
 
 
588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1070  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  40 
 
 
588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0961  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.72 
 
 
573 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  26.74 
 
 
596 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  23.4 
 
 
590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.2 
 
 
571 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  39.7 
 
 
587 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0989  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  29.85 
 
 
574 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  29.85 
 
 
574 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  25.58 
 
 
598 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.45 
 
 
605 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  25.96 
 
 
597 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  24.73 
 
 
619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1999  ABC transporter related  30.45 
 
 
571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0994183  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.95 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.83 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
219 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  24.63 
 
 
712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 
218 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  25.14 
 
 
1218 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  23.38 
 
 
583 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.47 
 
 
573 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.2 
 
 
571 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  22.88 
 
 
624 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.02 
 
 
571 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.51 
 
 
573 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1983  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.8 
 
 
579 aa  113  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.34 
 
 
593 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  27.51 
 
 
573 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.51 
 
 
573 aa  113  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  27.72 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  24.42 
 
 
712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  26.44 
 
 
581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.68 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  27.87 
 
 
573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>