93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1243 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1243  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1424    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0574  hypothetical protein  28.46 
 
 		 720 aa  294  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.765161  normal  0.718293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2910  hypothetical protein  29.96 
 
 		 966 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0866  hypothetical protein  25.71 
 
 		 722 aa  178  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.484671  normal  0.359405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.65 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  25.94 
 
 		 657 aa  94.7  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  25.28 
 
 		 643 aa  92.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  24.11 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.64 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  22.99 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.77 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 		 655 aa  61.6  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 1786 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20 
 
 		 609 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  21.76 
 
 		 706 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.21 
 
 		 625 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 875 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1792 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1782 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  19.57 
 
 		 608 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.08 
 
 		 632 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  27.84 
 
 		 629 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1784 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.45 
 
 		 677 aa  51.6  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.16 
 
 		 656 aa  50.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.17 
 
 		 600 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1771 aa  50.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  22.34 
 
 		 626 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.67 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.17 
 
 		 600 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.59 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.03 
 
 		 626 aa  50.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 657 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  20.36 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6319  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 		 601 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 1767 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.08 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.96 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.06 
 
 		 684 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0821  putative diguanylate cyclase  24.14 
 
 		 400 aa  48.5  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 698 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.71 
 
 		 658 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2500  hypothetical protein  25.83 
 
 		 356 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21 
 
 		 628 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 1767 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 622 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.12 
 
 		 678 aa  47.4  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21 
 
 		 628 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.36 
 
 		 596 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  23.83 
 
 		 652 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.99 
 
 		 630 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  27.66 
 
 		 629 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  21.91 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1767 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1443  hypothetical protein  25.21 
 
 		 313 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.99 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  20.56 
 
 		 629 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  21.16 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.99 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1967  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.44 
 
 		 1026 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.15 
 
 		 624 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.81 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  22.14 
 
 		 630 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  25.53 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.62 
 
 		 599 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.99 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20 
 
 		 658 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  23.18 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  25.42 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  20.5 
 
 		 643 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  20.68 
 
 		 834 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.29 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.67 
 
 		 659 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.29 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 675 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.69 
 
 		 1765 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  22.22 
 
 		 630 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  22.09 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.32 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.6 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.02 
 
 		 599 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 		 880 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  26.6 
 
 		 629 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  18.62 
 
 		 639 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 		 654 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  22.67 
 
 		 626 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  24.58 
 
 		 629 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.16 
 
 		 622 aa  44.3  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  27.5 
 
 		 699 aa  44.3  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.66 
 
 		 599 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  19.1 
 
 		 727 aa  43.9  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>