10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2500 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2799  hypothetical protein  74.55 
 
 		 353 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13061  normal  0.226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3198  hypothetical protein  70.14 
 
 		 354 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2754  hypothetical protein  72.34 
 
 		 353 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4264  neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding  22.91 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0355  hypothetical protein  21.35 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0273  hypothetical protein  23.72 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4110  hypothetical protein  19.34 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00135507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4071  hypothetical protein  19.34 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1243  hypothetical protein  25.83 
 
 		 698 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>