55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0574 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1470    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.765161  normal  0.718293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1243  hypothetical protein  28.42 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2910  hypothetical protein  26.26 
 
 		 966 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0866  hypothetical protein  23.22 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.484671  normal  0.359405 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  25.94 
 
 		 643 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  25.94 
 
 		 657 aa  128  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  27.42 
 
 		 648 aa  126  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  24.22 
 
 		 645 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.05 
 
 		 644 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  22.96 
 
 		 649 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 834 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.93 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 659 aa  62.4  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.86 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.72 
 
 		 678 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 776 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.24 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  30.36 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  30.07 
 
 		 629 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.14 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  29.76 
 
 		 629 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.36 
 
 		 624 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 		 677 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  24.83 
 
 		 548 aa  51.6  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 		 630 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.13 
 
 		 763 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  46.43 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.01 
 
 		 823 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.7 
 
 		 629 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.7 
 
 		 632 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.9 
 
 		 769 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0025752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.41 
 
 		 658 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 625 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 624 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 753 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  21.9 
 
 		 811 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.74 
 
 		 624 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  21.65 
 
 		 781 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.02 
 
 		 681 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 875 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 		 675 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 629 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  23.08 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  42.86 
 
 		 647 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.86 
 
 		 647 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 647 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 659 aa  45.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.1 
 
 		 632 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  21.05 
 
 		 708 aa  44.3  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>