More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1760 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1760  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 365 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 364 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.108678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.75 
 
 		 437 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3264  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.57 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.76 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.69 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.01 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 459 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  34.43 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.32 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  33.83 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.32 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  34.73 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  32.84 
 
 		 413 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.01 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 455 aa  175  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  34.4 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  34.71 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  34.4 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  33.61 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  32.54 
 
 		 435 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  32.98 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.76 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  35 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  33.82 
 
 		 434 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  32.01 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  33.06 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  34.01 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  33.24 
 
 		 576 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  31.14 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  33.33 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  33.33 
 
 		 442 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  33.24 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  33.23 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.4 
 
 		 462 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 457 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 462 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.02 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  33.93 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.9 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  31.23 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.2 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 		 445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  32.59 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  32.33 
 
 		 462 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.66 
 
 		 434 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  31.66 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  31.33 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.34 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 451 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.05 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 523 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.11 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  30.79 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1488  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  33.95 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  31.67 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  31.59 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  30.17 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  30.17 
 
 		 427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  30.17 
 
 		 444 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>