160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2909 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 414 aa  816    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  64.68 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  64.68 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  64.68 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  59.7 
 
 		 402 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  47.12 
 
 		 452 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  48.29 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  44.42 
 
 		 496 aa  292  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  44.42 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  52.29 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  38.44 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  35.47 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  33.08 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  31.75 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.68 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  32.14 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  31.2 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  34.67 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  32.14 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  28.91 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  34.46 
 
 		 351 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  35.75 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.63 
 
 		 298 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  26.75 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  30.17 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  30.69 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  29.55 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  22.22 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  26.94 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  26.72 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  29.61 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  27.78 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  28.17 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  25.53 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  25.8 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  25.8 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  25.71 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  27.76 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  28.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  28.06 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  28.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  28.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  27.67 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  26.56 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  25.79 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  31.82 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  29.54 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  27.43 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  28.65 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  26.02 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  28.18 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  31.21 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  28.4 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  28.4 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  32.03 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  24.05 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  27.55 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  27.83 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  31.44 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  27.61 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  27.49 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  26.45 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  28.22 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  29.17 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  27.12 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  22.73 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  28.23 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  29.39 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  22.73 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  25.55 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  23.14 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  23.14 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  22.09 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  25.81 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  29.17 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  28.15 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  24.14 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  24.05 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  32.43 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  22.44 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  28.29 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  31.53 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  31.53 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  24.48 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  28.01 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  25.4 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  22.76 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  22.76 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  22.36 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  27.36 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  22.76 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  31.75 
 
 		 626 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  27.64 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  28.99 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  29.11 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  28.05 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  33.61 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>