162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5250 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  100 
 
 		 404 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  100 
 
 		 404 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  99.5 
 
 		 404 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  68.5 
 
 		 402 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  64.74 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  46.87 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  47.07 
 
 		 436 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  44.47 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  45.61 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  46.96 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  40.31 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  35.59 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  35.15 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  30.74 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  32.4 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.93 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  36.84 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  30.63 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  27.52 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  27.25 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  40.71 
 
 		 351 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  30.6 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  40.65 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  27.87 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  26.87 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  31.47 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  31.09 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  29.08 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  27.55 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  29.46 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  27.45 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  29.8 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  29.3 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  35.25 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  28.91 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  28.91 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  28.91 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  26.1 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  27.78 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  22.97 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  24.8 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  27.03 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  25.7 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  26.91 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  29.79 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  27.59 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  24.38 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  24.9 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  23.88 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  25.4 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  26.25 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  28.11 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  24.9 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  29.34 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  30.08 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  28.75 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  25.57 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  27.67 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  26.78 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  27.27 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  28.63 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  25.31 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  26.64 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  26.98 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  29.46 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  28.08 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  26.85 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  26.85 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  25.62 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  25.79 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  25.61 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  30.77 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  25.61 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  33.93 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  28.04 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  29.11 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  29.79 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  30.36 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  27.12 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  24.79 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  27.84 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  26.45 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  22.68 
 
 		 209 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  25.1 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  20.96 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  27.24 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  26.46 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  28.45 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  26.32 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  30.4 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  30.4 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  30.4 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>