101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2428 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  100 
 
 		 394 aa  814    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  35.88 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  35.96 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  32.81 
 
 		 434 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  29.8 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  29.93 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  29.93 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  29.93 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  29.4 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  33.2 
 
 		 436 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  27.71 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  34.6 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  30.28 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  31.76 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  35.78 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  27.67 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  30.17 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  29.43 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  29.12 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  36.08 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  21.98 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  31.35 
 
 		 481 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  27.4 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  40.37 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  32.54 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  31.21 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  28.33 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  30.46 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.81 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  29.58 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  22.75 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  22.61 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  22.01 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  22.01 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  22.07 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  23.56 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  21.65 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  21.9 
 
 		 383 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  23.27 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  25 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  26.73 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  23.11 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  23.08 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  23.08 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  23.08 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  21.5 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  24.02 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  24.29 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  21.5 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  21.5 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  23 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  21.5 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  23.87 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  21.5 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  23.17 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  23.61 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  23.53 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  23.53 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  21 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  22.16 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  27.84 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  29.53 
 
 		 626 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  20.85 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  20.83 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33394  predicted protein  26.83 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.551934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  23.83 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  23.62 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  20.87 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  22.69 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  22.69 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  22.69 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  28.12 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  22.4 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  34.52 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  21.88 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  34.12 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  19.61 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  22.45 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  30.77 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  30.77 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  30.77 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  23.29 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  29.76 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  26.19 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  19.31 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  23.14 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  18.62 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  19.37 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  20.09 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  20.48 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  18.93 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  23.93 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  22.81 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  18.45 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  22.5 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  21.72 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  21.72 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  31.76 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  22.5 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  21.24 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>