104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  100 
 
 		 414 aa  808    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  51.6 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  51.27 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  46.37 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  46.37 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  46.37 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  46.51 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  45.96 
 
 		 432 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  46.06 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  45.32 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  43.35 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  38.43 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  33.1 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  34.91 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  35.81 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  35.02 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  30.49 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  34.21 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  29.75 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  25.84 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  33.17 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  31.84 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  34.83 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  27.19 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  32.45 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  36.29 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  32.42 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  27.14 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  25.91 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.18 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  29.17 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  31.52 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  27.97 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  31.37 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  28.07 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  31.17 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  37.8 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  29.31 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  29.31 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  29.56 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  29.56 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  29.56 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  30.52 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  26.39 
 
 		 626 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  28.83 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  30.37 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  27.62 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  26.99 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  28.93 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  34.41 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  32.93 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  34.44 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  27.93 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  28.99 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  32.48 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  24.15 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  26.92 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  26.92 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  31.3 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  30.25 
 
 		 235 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  30.77 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  26.34 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  34.94 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  36.59 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  26.88 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  36.59 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  36.14 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  27.87 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  27.51 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  34.94 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  32.61 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  34.94 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  34.94 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  34.94 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  34.94 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  34.94 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  22.63 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  25.65 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  26.25 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  24.52 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  35.37 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  35.37 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  26.29 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  26.29 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  35.37 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  31.07 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  24.38 
 
 		 374 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  26.11 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  26.11 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>