63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4378 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  100 
 
 		 403 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  35.03 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  35.84 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  35.59 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  35.59 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  37.77 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  37.67 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  35.57 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  37.44 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  35.83 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  36.73 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  38.06 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  28.82 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  30.19 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  30.17 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  28.37 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  28.07 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  27.13 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  30.96 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  27.01 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  29.73 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  28.23 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  35.34 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  27.17 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  32.1 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  25.96 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  27.52 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  24.21 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  27.59 
 
 		 626 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  25 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  29.33 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  33.95 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  30.53 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  25.39 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  25.35 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  28.97 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  30.67 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  27.59 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  30.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  26.3 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  26.3 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  26.3 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  26.3 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  29.22 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  28.99 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  32.19 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  33.72 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  26.34 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.33 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  26.3 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  31.52 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  27.33 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  30.82 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  30.43 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  27.27 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>