149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0385 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  100 
 
 
392 aa  807    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  35.88 
 
 
394 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  33.76 
 
 
432 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  32.15 
 
 
436 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  33.67 
 
 
452 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  38.49 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  33.25 
 
 
414 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  32.74 
 
 
496 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  35.15 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  35.15 
 
 
404 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  35.15 
 
 
404 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  37.7 
 
 
402 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  29 
 
 
397 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  28.82 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  37.93 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  32.34 
 
 
428 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  29.83 
 
 
385 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  31.32 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  34.74 
 
 
406 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  35.94 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  32.8 
 
 
481 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  28.57 
 
 
400 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  29.61 
 
 
392 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  29.61 
 
 
392 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  27.87 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  28.24 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  32.62 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  28.44 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  28.3 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  25.91 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  29.06 
 
 
515 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  23.21 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  22.7 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  28.04 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  22.83 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  22.45 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  26.75 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  25.2 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  24.55 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  28.91 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  28.63 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  26.42 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  23.79 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  24.6 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  26.42 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  24.74 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  27.14 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  24.74 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  26.42 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  28.62 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  24.81 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  27.78 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  25.69 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  29.35 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  27.11 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  24.56 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  26.67 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  26.67 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  25.88 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  27.99 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  26.67 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  26.67 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  24.07 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  27.18 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  27.65 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  27.65 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  27.65 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  26.05 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  26.89 
 
 
391 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  24.76 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  27.4 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  25.71 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  25.71 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  26.89 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  26.89 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  25.68 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  26.89 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  26.89 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  26.89 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  26.19 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  27.1 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  26.42 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  26.39 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  24.48 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  26.02 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  25 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  27.19 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  24.51 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  25.37 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  27.19 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  27.75 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  23.1 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  24.77 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  28.17 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  26.07 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  25.24 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  25.12 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  26.83 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  23.73 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  24.31 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>