57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2875 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  100 
 
 
384 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  35.97 
 
 
298 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  29.03 
 
 
385 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  30.48 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  29.05 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  27.87 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  30.48 
 
 
395 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  27.87 
 
 
404 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  27.87 
 
 
404 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  28.82 
 
 
496 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  28.14 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  26.75 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  29.69 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  32.91 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  28.98 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  26.58 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  30.36 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  26.91 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  25.23 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  23.9 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  27.37 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.58 
 
 
394 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  26.07 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  28.95 
 
 
515 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  25.16 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  37.66 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  26.06 
 
 
301 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  33.02 
 
 
481 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  34.21 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  25 
 
 
403 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  37.8 
 
 
402 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  25.57 
 
 
382 aa  49.7  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  25 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  31.91 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  25.84 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.3 
 
 
279 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  29.67 
 
 
239 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  34.12 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  33.33 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  25 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  37.04 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  20.56 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  28.81 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.76 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  24.46 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  40.85 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  32.94 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  31.76 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  20.98 
 
 
381 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  32.53 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  25.58 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  27.75 
 
 
386 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  26.61 
 
 
383 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  37.68 
 
 
379 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  34.67 
 
 
389 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  37.68 
 
 
379 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  37.68 
 
 
379 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>