79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1843 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  100 
 
 		 376 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  74.8 
 
 		 376 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  75.6 
 
 		 373 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  72.15 
 
 		 373 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  66.67 
 
 		 375 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  29.53 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.41 
 
 		 267 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  32.77 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.87 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  30 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  29.37 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  31.13 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.67 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  25.59 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  37.7 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  25.1 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  35.09 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.71 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.51 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  27.52 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  29.96 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  27.75 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.23 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.14 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.61 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.95 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.95 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  28.51 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  25.93 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  25.63 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.95 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.95 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  33.91 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  25.55 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  39.8 
 
 		 110 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  38.46 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  39.8 
 
 		 110 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  38.46 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.31 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  38.83 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  30.47 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.1 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  31 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  39.02 
 
 		 110 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  28.81 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.82 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.03 
 
 		 175 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  25.33 
 
 		 568 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  26.1 
 
 		 263 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.02 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  31.03 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  31.86 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  30.4 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  37.93 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  33.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  32.05 
 
 		 138 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05484  lipid transfer protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13280)  35.38 
 
 		 129 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  31.31 
 
 		 105 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  30.09 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  22.65 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  37.04 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  22.63 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  21.95 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  53.12 
 
 		 819 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  23.14 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  32.05 
 
 		 110 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  28.85 
 
 		 239 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  25.36 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>