21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24412 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  100 
 
 
563 aa  1132    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  30.72 
 
 
297 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  27.91 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  29.68 
 
 
338 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  33.04 
 
 
235 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  28.81 
 
 
344 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  28.79 
 
 
338 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  27.22 
 
 
335 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  31.86 
 
 
376 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  31.08 
 
 
373 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  26.2 
 
 
337 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.93 
 
 
334 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  29.36 
 
 
239 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.83 
 
 
281 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.83 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  27.11 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.43 
 
 
338 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  27.65 
 
 
323 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.32 
 
 
343 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.97 
 
 
376 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  37.14 
 
 
1068 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>