49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1606 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  55.28 
 
 		 323 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  44.89 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  42.31 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  42.01 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.72 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.49 
 
 		 339 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.11 
 
 		 338 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  38.76 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  42.12 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.33 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  48.76 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  44.67 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  40.45 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.69 
 
 		 334 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  42.26 
 
 		 317 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  37.13 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  43.59 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  40.12 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  38.82 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  29.11 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  28.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  34.78 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  27.52 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  37.25 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.22 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  24.29 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.31 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.91 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.57 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  29.68 
 
 		 563 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.67 
 
 		 175 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  31.67 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  28.95 
 
 		 198 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  27.16 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  35.96 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.03 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.13 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  25.53 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  33.01 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  35.34 
 
 		 508 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.12 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  29.36 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>