67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1310 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  71.86 
 
 		 339 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  71.56 
 
 		 339 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  71.56 
 
 		 339 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  71.6 
 
 		 339 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  68.14 
 
 		 338 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  49.55 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  48.21 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  44.81 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  45.54 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  47.63 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  42.12 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  43.09 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  42.3 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  43.08 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  39.3 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  40 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.06 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  34.84 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  38.14 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.78 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  30.81 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  34.29 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  24.62 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.17 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.11 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  31.11 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.97 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.72 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  38.67 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.98 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  22.19 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  24.23 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  30.85 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  35.16 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  31.78 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  35.29 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  28.1 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  29.57 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  33.98 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.97 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  33.33 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  28.49 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  23.05 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  32.08 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  27.27 
 
 		 1068 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.43 
 
 		 289 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.3 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.58 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  28.33 
 
 		 563 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 529 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  21.35 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  26.72 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>