62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02690 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  612  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  63.12 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  52.17 
 
 		 292 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  44.72 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  41.28 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  37.81 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  38.43 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.6 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.3 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.2 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  23.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  23.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  23.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  23.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  29.38 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  34.06 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.94 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  25.34 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  24.07 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  28 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.51 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  21.8 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  20.28 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  22.46 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  21.26 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  22.92 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  27.03 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.19 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.62 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  21.02 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  25.28 
 
 		 508 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  19.93 
 
 		 339 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.7 
 
 		 334 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  25.27 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  31.37 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  24.35 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  19.93 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  21.09 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  21.1 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.78 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  28 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  23.45 
 
 		 373 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  47.5 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  29.76 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.65 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.41 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  21.95 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  25.51 
 
 		 1068 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  26.47 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  31.71 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.13 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  20.85 
 
 		 586 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>