37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42117 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  100 
 
 
446 aa  920    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  41.69 
 
 
294 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  32.26 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  32 
 
 
308 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  29.45 
 
 
535 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  31.23 
 
 
586 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  27.06 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  30.66 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  22.31 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  25.81 
 
 
343 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.82 
 
 
279 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  29.38 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  29.38 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.01 
 
 
376 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  24.8 
 
 
292 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  23.08 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00210  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 
189 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  23.34 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.38 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  24.42 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  24.41 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53771  predicted protein  22.73 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229435  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  22.63 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.42 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.57 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  28.7 
 
 
348 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.46 
 
 
281 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.43 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  27.47 
 
 
337 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  22.73 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>