82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1641 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  82.04 
 
 
373 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  100 
 
 
373 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  72.34 
 
 
376 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  72.15 
 
 
376 aa  554  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  64.27 
 
 
375 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  30.56 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.32 
 
 
267 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  30.13 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.03 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.87 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  32.8 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  30.86 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  26.74 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  28.02 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  38.52 
 
 
348 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  23.36 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.15 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.29 
 
 
279 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.29 
 
 
334 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  27.31 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  29.1 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.16 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  24.58 
 
 
335 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  27.01 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  26.16 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  26.16 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  26.16 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  26.16 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.72 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  32.32 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.72 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.06 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  21.9 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  35.96 
 
 
116 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.81 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  26.2 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  30.47 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  25.74 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  26.2 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  25.42 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  31.09 
 
 
293 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  38.1 
 
 
110 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  38.1 
 
 
110 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  33.64 
 
 
175 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.29 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  38.1 
 
 
110 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  32.91 
 
 
104 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.61 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  35.04 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  33.64 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
104 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  35.96 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  32.74 
 
 
317 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
111 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  34.38 
 
 
105 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  24.68 
 
 
568 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.29 
 
 
819 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  26.09 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  32.03 
 
 
563 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  25.4 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  30.21 
 
 
104 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  30.21 
 
 
104 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  24.42 
 
 
446 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  30.36 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  31.58 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  27 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  33.33 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  23.45 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.36 
 
 
338 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  34.62 
 
 
138 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  23.65 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
103 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  29.41 
 
 
117 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  27.68 
 
 
239 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>