75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1301 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  100 
 
 		 402 aa  828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  29.58 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  29.53 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.47 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.93 
 
 		 376 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  30.56 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  32.68 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  31.62 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  32.2 
 
 		 338 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.3 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.17 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.34 
 
 		 332 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  38.32 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  35.34 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.28 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.94 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  27.78 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  25.42 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.19 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  26.85 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  21.8 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.14 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.3 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  36.21 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  31.33 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  24.9 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.07 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  25.4 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  22.81 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  24.38 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.28 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.92 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  27.88 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.92 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.63 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.14 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  25.57 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.23 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  32.46 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.37 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  22.75 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  24.03 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  24.9 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  31.07 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  24.81 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  34.34 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43870  predicted protein  36.45 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0960  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.83 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  21.21 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  37.8 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  26.11 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  36.36 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  35.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.04 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  35.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  26.72 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  34.09 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 529 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.78 
 
 		 819 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  22.73 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  29.46 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>