66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1970 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  99.62 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  99.62 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  98.48 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  98.48 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  98.48 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  98.48 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.87 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  29.06 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  25.93 
 
 		 418 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  30.66 
 
 		 446 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  29.76 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  25.38 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  23.6 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  27.76 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.98 
 
 		 288 aa  88.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  30.45 
 
 		 353 aa  86.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.29 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  32.24 
 
 		 434 aa  82.8  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.82 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.7 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.06 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  22.22 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.98 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  25.94 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  27.35 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  27.35 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  26.85 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  21.99 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  32.35 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  20.34 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  26.34 
 
 		 535 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  27.08 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  26.72 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  26.72 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.08 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  25.22 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  21.9 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.07 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  25.74 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.97 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.97 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  32.97 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  24.71 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.07 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  28.38 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  26.1 
 
 		 376 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.22 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.39 
 
 		 376 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.6 
 
 		 343 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  21.46 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48391  predicted protein  25.93 
 
 		 425 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42595  predicted protein  25 
 
 		 476 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  25.5 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  31.17 
 
 		 356 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  33.77 
 
 		 317 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  25.83 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  31.71 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.02 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  31.58 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>