69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1103 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  100 
 
 		 335 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  47.63 
 
 		 356 aa  342  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.22 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.39 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  46.22 
 
 		 339 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.53 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.81 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  45.32 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  43.45 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  41.39 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.37 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  40.83 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  37.13 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  40.07 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  36.92 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.83 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  37.3 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  33.85 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  37.23 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  33.22 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  32.85 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  38.32 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  24.9 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.7 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.04 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  24.6 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  33.93 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.27 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.94 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  32.95 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  32.95 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  34.92 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.51 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  25.93 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  34.65 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  33.08 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  34.92 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  22.31 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  22.31 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  22.31 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  22.31 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  35.45 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  23.9 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  21.9 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  35.04 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  33.04 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  21.9 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  21.9 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  34.74 
 
 		 198 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  31.07 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  35.04 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  22.47 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  21.09 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.66 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.75 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  21.56 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  27.22 
 
 		 563 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  28.04 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  37.8 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  31.13 
 
 		 508 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  29.91 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.41 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  27.12 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>