84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0224 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  99.43 
 
 
353 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  99.66 
 
 
294 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  99.66 
 
 
294 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  29.67 
 
 
353 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  29.22 
 
 
338 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.61 
 
 
332 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.4 
 
 
338 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  28.63 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  41.03 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.37 
 
 
267 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  35.12 
 
 
819 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  26.38 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  26.38 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  26.77 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  26.77 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  26.77 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  26.77 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  27.12 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  25.51 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  25.98 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.83 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  27.82 
 
 
508 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  25.59 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  24.91 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  26.38 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  25.39 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.34 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.66 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.85 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.33 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.57 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  26.84 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  23.76 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  24.6 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.37 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.23 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.12 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  26.1 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  25 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  30.82 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  28.93 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  32.11 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  24.69 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.19 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  23.21 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  37.25 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  36 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  30.84 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0960  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.49 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  23.32 
 
 
418 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  26.45 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  30.84 
 
 
175 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  33.65 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.47 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  26.86 
 
 
434 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  34.31 
 
 
373 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.61 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  23.74 
 
 
535 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.91 
 
 
279 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  32 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  25.62 
 
 
586 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.58 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  20.89 
 
 
1068 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  29.13 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  21.07 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  22.09 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  21.27 
 
 
568 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  28.47 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  28.57 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  28.19 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  30.11 
 
 
198 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  32.03 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  31.03 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31860  predicted protein  24.79 
 
 
136 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48391  predicted protein  23.04 
 
 
425 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5931  hypothetical protein  27.55 
 
 
200 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0435002 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  28.45 
 
 
384 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>