59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0373 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  65.41 
 
 
293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  42.66 
 
 
291 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  44.72 
 
 
294 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  41.84 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.3 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  41.26 
 
 
284 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  33.8 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
353 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
294 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.62 
 
 
338 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  27.73 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.12 
 
 
332 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.63 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  26.09 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  38.46 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  37.62 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  26.56 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  21.99 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  21.99 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  21.99 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  22.41 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  22.41 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  22.41 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  22.41 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.13 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  24.89 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  24.9 
 
 
402 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  33.62 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  22.99 
 
 
369 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  28.7 
 
 
175 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  21.18 
 
 
418 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  22.73 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.98 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  31.09 
 
 
373 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.25 
 
 
376 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.36 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  28.81 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  21.59 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.73 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.78 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  21.56 
 
 
335 aa  49.3  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.06 
 
 
338 aa  48.9  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.83 
 
 
339 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  22.59 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  26.07 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.93 
 
 
339 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  28.36 
 
 
198 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  24.1 
 
 
320 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.78 
 
 
819 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  20.97 
 
 
535 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  22.66 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.69 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  26.89 
 
 
508 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  21.52 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>