77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  100 
 
 
375 aa  769    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  66.67 
 
 
376 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  66.4 
 
 
373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  65.08 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  64.27 
 
 
373 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  29.58 
 
 
402 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.49 
 
 
267 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  31.54 
 
 
353 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.46 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.32 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.46 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.72 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.83 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  31.08 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  37.72 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  25.99 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  24.7 
 
 
338 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.29 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  36.07 
 
 
348 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  27.19 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.06 
 
 
281 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  37.39 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.73 
 
 
288 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  32.82 
 
 
369 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  32.82 
 
 
175 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  22.89 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  35.04 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  24.46 
 
 
294 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  28.91 
 
 
320 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.99 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  27.16 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  36.71 
 
 
116 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  32.91 
 
 
117 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  21.4 
 
 
292 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  24 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.96 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  23.75 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  24.71 
 
 
263 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.77 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  33.02 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  31 
 
 
105 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  23.36 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  21.1 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.02 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  30.93 
 
 
105 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  31.3 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
111 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  22.59 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  21.4 
 
 
446 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  30.43 
 
 
105 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.49 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  29.27 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  33.63 
 
 
323 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  30.21 
 
 
103 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  30.68 
 
 
105 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
105 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  29.55 
 
 
105 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  22.86 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  22.69 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  23.39 
 
 
293 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
105 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  29.06 
 
 
563 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  27.78 
 
 
819 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>