68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1852 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  48.69 
 
 
356 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  51.83 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  50.75 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  47.63 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.97 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.09 
 
 
339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  45.8 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  42.69 
 
 
343 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  47 
 
 
339 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.93 
 
 
339 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  46.33 
 
 
338 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  46.84 
 
 
323 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  39.07 
 
 
335 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  43.04 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  41.37 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  42.81 
 
 
334 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  41.67 
 
 
338 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  41.74 
 
 
344 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  40.06 
 
 
345 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.27 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.2 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  30.57 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.44 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  30.43 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.32 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  34.71 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  36.19 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  27.34 
 
 
402 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  35.96 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  35.56 
 
 
175 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.71 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  34.29 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  32.37 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  29.38 
 
 
198 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  26.74 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.08 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.06 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  27.6 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  27.6 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  27.6 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.23 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.79 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25.2 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  29.82 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  29.82 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.72 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  31.53 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  24.34 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.62 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  25.19 
 
 
508 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  26.88 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1427  hypothetical protein  26.67 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  22.75 
 
 
1068 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  23.32 
 
 
563 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  31.37 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  27.45 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  27.93 
 
 
293 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>