69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4653 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  100 
 
 		 284 aa  590  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  41.26 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  40.42 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  38.19 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  37.85 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  38.43 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  37.46 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  38.95 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  27.87 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  27.87 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  27.87 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  32.1 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  27.46 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  27.46 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  27.46 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  27.46 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.08 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.55 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.34 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  26.47 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  23.94 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.58 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  26.83 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.94 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.9 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  32.17 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  24.7 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  23.79 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  25.11 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  24.9 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.17 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  31.62 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.47 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.93 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.89 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  25.31 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.94 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.41 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.99 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  23.61 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  32.38 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  25.27 
 
 		 1068 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  36.14 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  28.57 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  26.38 
 
 		 373 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.35 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  26 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  24.86 
 
 		 819 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  28.57 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  22.12 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  23.56 
 
 		 323 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  29.7 
 
 		 568 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  23.43 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.72 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  22.27 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  28.67 
 
 		 508 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  21.72 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  21.72 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.73 
 
 		 345 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>