68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0552 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  98.86 
 
 
263 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  98.86 
 
 
263 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  98.48 
 
 
263 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  30.34 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.46 
 
 
284 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  30.66 
 
 
446 aa  95.5  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  26.18 
 
 
418 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  25.38 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  23.97 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  29.37 
 
 
384 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.4 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  27.38 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  30.45 
 
 
353 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  32.65 
 
 
434 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.29 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.7 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  28.63 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  22.65 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.06 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
353 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  26.78 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  27.64 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  27.64 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.55 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  26.85 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  31.91 
 
 
586 aa  68.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  22.41 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  20.76 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  26.34 
 
 
535 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  27.48 
 
 
175 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  27.48 
 
 
369 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  27.08 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.08 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  22.31 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  26.16 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  25.22 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.07 
 
 
338 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.16 
 
 
339 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  25.11 
 
 
348 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.97 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.97 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  32.97 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  23.64 
 
 
375 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.12 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.67 
 
 
376 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.87 
 
 
339 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  24.6 
 
 
376 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  31.17 
 
 
356 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42595  predicted protein  25 
 
 
476 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  25.5 
 
 
198 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  25.83 
 
 
297 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48391  predicted protein  25.4 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  21.03 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  33.77 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  31.17 
 
 
343 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  30.49 
 
 
337 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  32.14 
 
 
344 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  30.32 
 
 
819 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.1 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>