76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4326 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  89.64 
 
 		 338 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  70.09 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  34.37 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  39.53 
 
 		 819 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  27.6 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.42 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  28.35 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  29.61 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  26.61 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  27.62 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  27.17 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  26 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.13 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.58 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.9 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  26.36 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  28.63 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  28.63 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  28.63 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  28.63 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  27.82 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  27.82 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  27.82 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  29.37 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  25 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  27.46 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.5 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  25.3 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  25.18 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  34.82 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.51 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  34.82 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  32.71 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  26.95 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  24.9 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  33.08 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  35.59 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  25.79 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.64 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.94 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.78 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  32.73 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.68 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  22.55 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  29.91 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  22.78 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  23.03 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  30 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48391  predicted protein  28.14 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.92 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.11 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.2 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0960  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.96 
 
 		 392 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  22.81 
 
 		 535 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  30.56 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  27.73 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  31.43 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  31.34 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  27.07 
 
 		 434 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  23.08 
 
 		 1068 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92148  predicted protein  23.41 
 
 		 617 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.17 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  31.36 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1842  transcription factor jumonji/aspartyl beta- hydroxylase  25.86 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  23 
 
 		 529 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  25.5 
 
 		 481 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  30.59 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  29.25 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>