18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0960 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0960  transcription factor jumonji jmjC domain protein  100 
 
 		 392 aa  815    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0140  hypothetical protein  29.52 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.24 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  26.69 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  26.69 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  26.69 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.92 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5931  hypothetical protein  23.83 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0435002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  27.83 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1427  hypothetical protein  30.1 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  23.96 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  22.78 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  21.51 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.93 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>