42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46234 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  100 
 
 		 535 aa  1119    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  32.39 
 
 		 586 aa  200  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  41.1 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  34.71 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  29.45 
 
 		 446 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  33.18 
 
 		 294 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  31.06 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  27.18 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  31.36 
 
 		 369 aa  67  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  31.36 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.91 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  23.53 
 
 		 291 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31860  predicted protein  32.04 
 
 		 136 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  22.81 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.53 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  29.86 
 
 		 390 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  29.86 
 
 		 390 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.87 
 
 		 279 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  20.56 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.68 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0140  hypothetical protein  26.53 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.68 
 
 		 339 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  20.97 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  25 
 
 		 343 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.68 
 
 		 339 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 294 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.56 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 294 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  23.63 
 
 		 294 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  29.17 
 
 		 356 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  59.26 
 
 		 338 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>