67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1141 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  72.51 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  72.81 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  73.91 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  71.9 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  68.14 
 
 		 339 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  50.6 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  51.06 
 
 		 343 aa  351  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  46.39 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  46.73 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.97 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  42.12 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  41.11 
 
 		 338 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  44.83 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  40.37 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.82 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  40.41 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  39.56 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.13 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  35.48 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  35.8 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  34.19 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.57 
 
 		 281 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  32.38 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  25.3 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  25 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.6 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  33.09 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.38 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  29.55 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  29.55 
 
 		 175 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  36.27 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.04 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  29.93 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  32.38 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  28.82 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.37 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  28.06 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.17 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  30.51 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  28.46 
 
 		 1068 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  23.35 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  27.89 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 529 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  28.42 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.96 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  31.43 
 
 		 563 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  31.36 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  59.26 
 
 		 535 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  22.13 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.55 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  32.71 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  32.71 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  29.69 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>