48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42544 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  42.68 
 
 
373 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  33.88 
 
 
1068 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  38.21 
 
 
334 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  34.21 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.81 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.09 
 
 
339 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.04 
 
 
339 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.97 
 
 
339 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  35.45 
 
 
337 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.35 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  35.45 
 
 
335 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  37.08 
 
 
348 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  32.43 
 
 
356 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  31.58 
 
 
335 aa  55.1  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.93 
 
 
338 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  39.22 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  26.74 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  29.63 
 
 
344 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  31.43 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  31.37 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01870  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
529 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  32.77 
 
 
338 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 
434 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  25.71 
 
 
323 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  27.15 
 
 
400 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  32.95 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  29.67 
 
 
384 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  29.29 
 
 
432 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  25 
 
 
385 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.53 
 
 
343 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  30.23 
 
 
452 aa  45.1  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  29.36 
 
 
563 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  28.28 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  27.83 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  32.14 
 
 
436 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  28.85 
 
 
376 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  27.68 
 
 
373 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  29.36 
 
 
338 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1917  transcription factor jumonji, JmjC  26.32 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.208156  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1065  transcription factor jumonji, jmjC  25.44 
 
 
293 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.12 
 
 
332 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  26.43 
 
 
402 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  27.12 
 
 
320 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  23.53 
 
 
401 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1682  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.83 
 
 
328 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  28.28 
 
 
338 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>