54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2409 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  44.44 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.72 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.74 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  34.05 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  39.31 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  36.77 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.77 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.77 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.77 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  35.67 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  31.53 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.48 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  38.99 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  37.54 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  38.82 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.84 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  35.86 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  33.87 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  33.22 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  39.22 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.92 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.86 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  29.96 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  21.88 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  37.82 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  30.32 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  36.19 
 
 		 175 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  27.31 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  27.88 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.59 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  25.09 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.38 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  31.3 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  29.63 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  35.85 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  30.89 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  28.81 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  26.11 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  30.08 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  30.08 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  30.08 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  32.11 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  30.08 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  32.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  32.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  32.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  33.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  28.89 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.83 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  28.57 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  30.93 
 
 		 432 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  32.41 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  29.25 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>