70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3735 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  43.77 
 
 		 356 aa  315  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  41.82 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.24 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  43.94 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  43.33 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  43.64 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  43.07 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  42.12 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  38.76 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.47 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  43.32 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.07 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  39.1 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  40.83 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  39.37 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  36.31 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  31.53 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  35.56 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.95 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  32.16 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.37 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  25.37 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  25.37 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  25.39 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.39 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.39 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.39 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  26.52 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.91 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.56 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  24.79 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  33.33 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.03 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  25.4 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  25.63 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.71 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.1 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  24.58 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.1 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  26.59 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  22.89 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  25.83 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  31.58 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25.79 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.38 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  23.41 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  30.1 
 
 		 353 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  29.03 
 
 		 1068 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  25.96 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  26.37 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  21.46 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  21.46 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  21.46 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.04 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  24.39 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  24.81 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  33.7 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  34.21 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  21.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  21.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  21.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  21.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  32.38 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.81 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  22.62 
 
 		 568 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  25.6 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>