21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35781 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  100 
 
 
385 aa  802    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86569  predicted protein  27.27 
 
 
364 aa  123  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  27.01 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.9 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.62 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  25.55 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.53 
 
 
235 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  27.03 
 
 
508 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  28.4 
 
 
317 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  23.36 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  23.78 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  26.11 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91178  predicted protein  24.18 
 
 
529 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.394428  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87326  predicted protein  41.18 
 
 
416 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  25 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.06 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.89 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  26.95 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  29.07 
 
 
338 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00888  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15510)  21.74 
 
 
568 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  27.4 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>