49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2065 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  100 
 
 
338 aa  679    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  42.11 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.08 
 
 
334 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  44.79 
 
 
337 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.56 
 
 
338 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  40 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  43.59 
 
 
338 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.05 
 
 
339 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.05 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  39.05 
 
 
339 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  38.19 
 
 
317 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  40.81 
 
 
345 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  38.41 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.67 
 
 
343 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  38.82 
 
 
323 aa  238  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  33.85 
 
 
335 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  39.31 
 
 
344 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  36.31 
 
 
343 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  35.56 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  37.74 
 
 
348 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  26.46 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  37.61 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  35.96 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  28.35 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  25.1 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  24.7 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.31 
 
 
281 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.53 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.39 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
294 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  36.36 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.51 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  24.81 
 
 
402 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  26.83 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  30.09 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  32.77 
 
 
239 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.59 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  29.01 
 
 
563 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  21.72 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  22.27 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  21.43 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  31.62 
 
 
508 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35781  predicted protein  29.07 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>