69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1122 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  95.28 
 
 
339 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  94.99 
 
 
339 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  94.69 
 
 
339 aa  678    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  72.51 
 
 
338 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  71.6 
 
 
339 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  50.73 
 
 
343 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  48.98 
 
 
356 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  45.32 
 
 
335 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  45.27 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  43.33 
 
 
335 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  41.49 
 
 
338 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  44.93 
 
 
343 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  46.37 
 
 
317 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.59 
 
 
334 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  41.85 
 
 
323 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  41.49 
 
 
348 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.13 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  39.05 
 
 
338 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  36.77 
 
 
344 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  36.36 
 
 
297 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.45 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  29.05 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  33.33 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  33.09 
 
 
239 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.3 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  32.43 
 
 
175 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  32.74 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  24.57 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.21 
 
 
281 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  21.4 
 
 
267 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  23.29 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  27.16 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  20.86 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  23.14 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  22.05 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  29.95 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  35.05 
 
 
198 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  29.93 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  30.97 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  19.93 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  32.77 
 
 
508 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  33.96 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.8 
 
 
373 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  32.11 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  31.87 
 
 
263 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  32.22 
 
 
263 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  31.87 
 
 
263 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  31.87 
 
 
263 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  31.87 
 
 
263 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.19 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.19 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  24.9 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  32.22 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  32.22 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  28.18 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00128  Leucine carboxyl methyltransferase 2 (EC 2.1.1.-)(tRNA wybutosine-synthesizing protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH52]  28.7 
 
 
1068 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  22.44 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  27.93 
 
 
293 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10542  JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06210)  29.01 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  31.68 
 
 
535 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.12 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  38.96 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  26.4 
 
 
418 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>