66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03820 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  52.17 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0802  transcription factor jumonji domain-containing protein  49.65 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  41.84 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0347  transcription factor jumonji jmjC domain protein  38.57 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  38.95 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  36.27 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  37.46 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  28.35 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.9 
 
 		 332 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  27.95 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.51 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  25.75 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  26.13 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  22.65 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  22.65 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  22.65 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  22.22 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  22.65 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  22.22 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.45 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  22.22 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.45 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.45 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.13 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  26.13 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  23.28 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.78 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  28.37 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  34.82 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.62 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  24.9 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  25.42 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  26.52 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  25 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  27.19 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  37.11 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  23.67 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  34.74 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  33.68 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  32.62 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  23.51 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  27.78 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  26.86 
 
 		 819 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.38 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  27.78 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  23.81 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  26.34 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  25.3 
 
 		 373 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  31.43 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  21.4 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  27.68 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  24.8 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13914  predicted protein  27.59 
 
 		 508 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  21.95 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.17 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  22.65 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  21.03 
 
 		 376 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  27.59 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>