52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0917 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  100 
 
 		 323 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  55.28 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  47.22 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  43.96 
 
 		 356 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  46.77 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  40.37 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  41.72 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  46.84 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.82 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  40.74 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  42.17 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.85 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  39.1 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  39.3 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  43.75 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  39.06 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  36.92 
 
 		 335 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  41.85 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  38.82 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  33.87 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  27.17 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  26.94 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  28.42 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.71 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  38.36 
 
 		 175 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  32.58 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31334  predicted protein  28.95 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  24.6 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  27.68 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  32 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.45 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.06 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  25.71 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  34 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.69 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  33.33 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  33.63 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93062  predicted protein  29.57 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.511248  normal  0.323851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  31.43 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.56 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1737  hypothetical protein  27.91 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1737  hypothetical protein  27.91 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  27.33 
 
 		 563 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  26.47 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  29.46 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  24.35 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>