53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0457 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0457  transcription factor jumonji domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.822496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3029  transcription factor jumonji domain-containing protein  59.26 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  35.9 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1852  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.27 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  31.85 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2829  Pass1-related protein  31.34 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.960611  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1141  transcription factor jumonji domain-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  29.86 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.17 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3180  transcription factor jumonji jmjC domain protein  28.57 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02803  pass1 domain protein  30.6 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2065  PASs1-related protein  32.31 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.018525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  33.87 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1103  Pass1-related protein  29.27 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.89 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.13 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1210  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.89 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  34.15 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.21 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2742  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.51 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.86444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  32.23 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.59 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  33.06 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  29.03 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  29.6 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  33.63 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  31.36 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1606  hypothetical protein  29.31 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  34.23 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  27.43 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0917  PASs1-related protein  26.71 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  33.65 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  30.25 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  27.13 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  35.56 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  26.39 
 
 		 369 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1310  transcription factor jumonji domain-containing protein  23.97 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  32.22 
 
 		 515 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  29.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  29.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  29.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  29.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  29.17 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24412  predicted protein  27.83 
 
 		 563 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00369608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  30.12 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  28.46 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39523  predicted protein  27.35 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0537777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  30.09 
 
 		 434 aa  42.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  28.35 
 
 		 418 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  25 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>