155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02373 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  100 
 
 		 388 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  44.28 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  37.98 
 
 		 373 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  37.74 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  38.61 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  37.2 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  37.2 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  37.2 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  38.61 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  38.52 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  38.07 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  38.54 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  37.47 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  37.47 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  37.04 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  37.47 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  38.48 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  38.07 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  37.7 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  37.47 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  37.14 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  37.2 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  37.37 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  36.66 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  37.34 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  39.16 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  36.89 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  36.61 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  36.93 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  37.43 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  36.89 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  37.4 
 
 		 385 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  37.4 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  36.87 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  36.68 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  37.13 
 
 		 373 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  37.4 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  37.4 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  48.95 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  33.69 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  36.59 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  48.1 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  36.46 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  35.83 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  36.34 
 
 		 376 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  35.31 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  35.04 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  35.31 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  37.61 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  35.29 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  35.82 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  34.83 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  37.58 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  41.1 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  34.38 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  34.09 
 
 		 388 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  32.63 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  39.24 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.56 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  32.37 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  32.37 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  35.93 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  35.93 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  32.95 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  35.35 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  35.5 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  32.38 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  33.06 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  33.53 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  34.77 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  39.02 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  32.71 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  41.4 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  41.36 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  34.39 
 
 		 383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  31.12 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  33.62 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  36.98 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  31.23 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  37.45 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  41.85 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  31.18 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  33.05 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  40.93 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  36.76 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  40.18 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  36.36 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  39.81 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>