148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1339 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 434 aa  836    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  43.36 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  42.93 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  41.73 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  45.06 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  40.67 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  40.67 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  40.67 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  40.91 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  39.71 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  42.9 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  37.56 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  32.35 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  31.44 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  31.17 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  34.04 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  30.06 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  31.87 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  29.71 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  31.06 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  31.55 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  31.66 
 
 		 515 aa  94.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  36.84 
 
 		 351 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  29.52 
 
 		 395 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  31.22 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  28.98 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  33.9 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  27.19 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  26.29 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  26.25 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  27.35 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  30 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  34.46 
 
 		 626 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  26.46 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  26.89 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  26.67 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  27.5 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  27.39 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  22.8 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  28.3 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  24.39 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  24.77 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  24.57 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  22.96 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  24.39 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  24.39 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  24.77 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  26.06 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  27.09 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  27.87 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  27.35 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  25.1 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  25.1 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  29.1 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  22.48 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  27.31 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  25.1 
 
 		 379 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  29.01 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  25.68 
 
 		 418 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  24.74 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  26.18 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  26.18 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  26.18 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  30.33 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  26.18 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  29.01 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  28.96 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  35.16 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  32 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  24.8 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  30.33 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  24.35 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  29.22 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  32.28 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  33.33 
 
 		 239 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  35.63 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  28.5 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 375 aa  51.2  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  31.5 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  29.92 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  29.95 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  29.92 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  29.92 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  29.95 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  26.03 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  28.45 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  25.64 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  26.98 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  32.54 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  34.83 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  34.07 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  34.07 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  30.4 
 
 		 373 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  24.48 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  27.27 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  35.29 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  31.2 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>