38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8956 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 395 aa  803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  44.47 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  37.17 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  35.74 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  33.92 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  30.34 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  27.66 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  29.89 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  31.8 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  33.85 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  32.18 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  30.6 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  30.6 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  27.01 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  30.6 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  31.94 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  29.52 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  28.3 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  29.66 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  32.54 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  30.36 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  30.17 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  29.38 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  28.23 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  26.37 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.08 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  29.2 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  26.72 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46687  predicted protein  30.72 
 
 		 626 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  33.33 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  23.4 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  23.74 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1144  cupin 4  24.55 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.929566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  23.75 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  28.41 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>