140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3066 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  100 
 
 		 452 aa  892    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  50.12 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  49.77 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  47.22 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  46.87 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  46.87 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  46.87 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  47.77 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  50.25 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  53.61 
 
 		 414 aa  275  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  41.79 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  35.03 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  33.67 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  32 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  34.67 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  29.4 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  27.3 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  28.74 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  28.32 
 
 		 298 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  34.36 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  25.91 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  27.51 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  28.85 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  28.14 
 
 		 384 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  31.25 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  25.62 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  34.29 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  27.35 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1460  hypothetical protein  28.06 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  27.76 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  28.45 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  26.32 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  26.56 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  26.5 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  38.26 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  25.35 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  37.27 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  25.26 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  25.44 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  25.44 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  33.04 
 
 		 402 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  31.58 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  34.95 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  32.46 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  23.01 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  29.05 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  25.75 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  27.35 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  27.31 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  26.07 
 
 		 381 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  32.77 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  31.09 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  32.77 
 
 		 375 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  26.96 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  24.3 
 
 		 373 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  24.07 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  24.9 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  26.46 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  30.83 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  26.96 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  23.51 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  26.96 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  26.96 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  31.43 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  25 
 
 		 379 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  23.05 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  25.56 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  23.24 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  31.43 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  23.83 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  30.48 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  25.56 
 
 		 379 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  32.47 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  26.46 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  27.52 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  24.2 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  30.19 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  21.65 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  23.24 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  32.73 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  23.55 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  23.21 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  25.11 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  23.55 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  28.21 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  22.71 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  22.71 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  30.28 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  27.12 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  33.7 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  25.78 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  25.11 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  23.55 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  23.55 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  23.55 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>