137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3059 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3059  cupin 4 family protein  100 
 
 		 298 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2875  cupin 4 family protein  35.97 
 
 		 384 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.0729467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3066  Cupin 4 family protein  28.32 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  hitchhiker  0.00228521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3174  cupin 4 family protein  30.91 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1529  Cupin 4 family protein  27.98 
 
 		 400 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.567254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3032  cupin 4  28.84 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0159331  hitchhiker  0.00213714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1857  hypothetical protein  25.38 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1339  Cupin 4 family protein  31.55 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.696496  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5269  Cupin 4 family protein  28.96 
 
 		 395 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2151  cupin 4 family protein  28.65 
 
 		 496 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247247  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0373  hypothetical protein  27.06 
 
 		 428 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.373081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8956  Cupin 4 family protein  27.01 
 
 		 395 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02500  Cupin superfamily protein  25.84 
 
 		 414 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0394  cupin 4  28.24 
 
 		 406 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0337  cupin 4 family protein  28.65 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3279  Cupin 4 family protein  26.42 
 
 		 436 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2909  Cupin 4 family protein  28.63 
 
 		 414 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5250  cupin 4  29.08 
 
 		 404 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5339  cupin 4 family protein  29.08 
 
 		 404 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77653  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5630  cupin 4 family protein  28.57 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2302  cupin 4 family protein  29.17 
 
 		 432 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0977306  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0385  cupin 4  32.62 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2428  cupin 4 family protein  31.21 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0823  cupin region  25.69 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1708  hypothetical protein  24.55 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14981  predicted protein  42.57 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15879  predicted protein  30.39 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45348  predicted protein  27.36 
 
 		 481 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  27.59 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  31.01 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4378  cupin 4 family protein  25.96 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  26.75 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  27.74 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  27.97 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  28.77 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  30.07 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  26.78 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  40.96 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  37.5 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  26.78 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  33 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  26.23 
 
 		 422 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  34.69 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  26.21 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  27.81 
 
 		 383 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  34.69 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  34.69 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  26.06 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  34.69 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  33.67 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  27.92 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  26.35 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  29.6 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  29.6 
 
 		 407 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  29.6 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  34.69 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  22.84 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  28.57 
 
 		 402 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  24.86 
 
 		 409 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  33.67 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  31.63 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  24.86 
 
 		 375 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  27.92 
 
 		 373 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  33.67 
 
 		 373 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  33.67 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  26.97 
 
 		 373 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  27.62 
 
 		 415 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  29.13 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  38.55 
 
 		 379 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42544  predicted protein  31.37 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.165779  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  27.27 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  38.55 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  38.55 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  31.87 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  32.61 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  30.61 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  32.61 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  32.65 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  26.85 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  24.86 
 
 		 383 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  30.61 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  36.36 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  25.52 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  32.35 
 
 		 379 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  27.74 
 
 		 373 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  31.67 
 
 		 373 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  33.33 
 
 		 407 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  27.78 
 
 		 397 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>